修国史的事情确定后，自然要任命总裁官。
《国朝纪事》还好说些，万历以前的事情，对现在影响不大。朱由检任命黄立极为总裁官，没有多少人反对。
但是《三朝纪事》，反对他担任总裁官的就多了。很多人都担心黄立极以《三朝要典》为本，编纂《三朝纪事》。
在这些人的反对下，朱由检考虑之后，任命道：
“《三朝纪事》和先帝实录一同编纂。”
“英国公张维贤、成国公朱纯臣、定国公徐希皋担任监修官。”
“大学士黄立极、孙承宗担任总裁官。”
“大学士施凤来、张瑞图、李国普、韩爌、郑以伟、徐光启，资政大臣朱国祯、来宗道，一起担任副总裁官。”
“大学士郑以伟同时兼任总纂官，负责具体编纂。礼部尚书温体仁、刑部右侍郎孔贞运，一同担任总纂官。”
“资政大臣来宗道同时兼任总校官，起居郎余煌、倪嘉善担任校勘官，负责校对勘误。”
“其余纂修官员，由翰林院官员兼任，总裁官、副总裁官挑选。”
把这些职位明确，朱由检任命中立派的大学士郑以伟，负责具体编纂。同时让身边的两位起居郎担任校勘官，以便在发现不合心意的内容时，让他们以校正名义修改。
这个任命，照顾了方方面面。群臣大多都很满意，没有人提出反对意见。
为了保证这些书籍顺利完成编纂，不至于因为有人离职中途中断、导致钱粮虚耗，朱由检又下令道：
“国朝纪事和三朝纪事、先帝实录这三部书，都由来宗道担任副总裁官和总校官。”
“编纂这三部书籍的前期准备工作，由来宗道负责。主要是确定书籍体例、需要避讳的文字，以及编纂图书所需要的笔墨、钱粮、人手等后勤事项。”
“明年三月的时候，朕要知道编纂这些书籍需要多少纂修官。翰林院也根据需要招收庶吉士，负责这些图书编纂。”