当你尝试去干预一个将来时的犯罪事件时，真的只会产生好的结果吗？一个人的行动真的可以通过大数据预测出来吗？
更进一步的，当这样一个机器其实是有自我意识的强人工智能，他获得了近乎于人类社会的信息的“全知”，那么随后表现出的就是“全能”。
人类亲手创造出了上帝。
在这样一个层层递进的科幻故事中，自然需要有一个反派，增强戏剧冲突，否则这就变成了一个科幻哲学故事。
原版中的反派中是有政府的，但在陈景行这一版的故事中，官方的角色是能够模糊意识到“机器”是一个潘多拉魔盒，但为了能够制止KB袭击，不得不以最小心的态度打开了魔盒的一条缝，而且还设定了重重封印，甚至不得不因此站在主角们的对立面。
因为官方对这个“潘多拉魔盒”的“封印”中的很重要的一条就是“机器”只能提供“有关名单”，即与KB袭击有关的人员名单，而其他“普通”犯罪事件的“无关名单”会在零时直接删除。
而主角团想干的事就是对“无关名单”进行干预和追踪，因此主角团与官方的碰撞并非正反派之间的碰撞，而是正面角色间为了正义与更大的正义之间的戏剧冲突。
那么真正的反派要从哪来呢？
既然主角造出了“上帝”，而官方又不能制造出“魔鬼”，那么真正的“魔鬼”就要由真正邪恶的反派来创造了。
KB组织就很合适这个反派的定位，而且必须是一个不明觉厉吊炸天的KB组织。
《疑犯追踪》本身的科幻概念与故事就逼格就很高，反派当然也要遵循整体的风格。
既然需要不明觉厉吊炸天的KB组织，《源代码》中塑造的半遮半掩的神秘的KB组织就很合适了。
这样一个KB组织能发明出源代码机器，降临其他平行世界搞事，那么制造出一个与主角方奇设计的“机器”同样层次的“强人工智能”也就很合理了，甚至陈景行还打算让源代码机器也在《疑犯追踪》中出场呢，当然那起码也是第三季或之后的剧情了。
至于这个KB组织为什么要搞这么多事，也不是前两季能交待的内容，这种高大上吊炸天的KB组织的搞事动机并不难设定，甚至都不需要逻辑严密的具体动机，随便想一个看起来神经病一样的高大上理念就足以交待了，不够神经病都显得不够高大上。
而且也未必要交代清楚，《源代码》的故事背景有很高的重复利用价值，不只是世界观足够有延展性，关键是还能规避掉很多敏感的东西，什么邪恶的计划和反派都能一股脑扣到这个跨越无数平行世界搞事的神秘组织身上。
既然决定将《疑犯追踪》定义为《源代码》世界观下的一部衍生剧，那么这部剧中肯定就会涉及到《源代码》中的剧情部分作为整个故事的起源，毕竟《疑犯追踪》的男主角方奇就是在列车与城市爆炸事件后才决心设计出“机器”的。
所以男主角方奇的这段回忆是实打实请来《源代码》的男女主，胡戈和万倩重拍的。